Molekulārajā bioloģijā STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) ir bioloģiskā datubāze un tīmekļa resurss par zināmām un prognozēm proteīnu un olb altumvielu mijiedarbībām. … Jaunākā versija 11b satur informāciju par aptuveni 24,5 miljoniem proteīnu no vairāk nekā 5000 organismiem.
Kāds ir STRING datu bāzes mērķis?
STRING datubāzes mērķis ir apkopot un integrēt šo informāciju, konsolidējot zināmos un prognozētos proteīnu asociācijas datus par lielu skaitu organismu.
Kas ir STRING rezultāts?
Strādā STRING katrai proteīna un proteīna mijiedarbībai ir pievienots viens vai vairāki punkti. Svarīgi, ka šie rādītāji nenorāda uz mijiedarbības stiprumu vai specifiku. Tā vietā tie ir pārliecības rādītāji, t.i., cik liela iespējamība, ka STRING mijiedarbību novērtē par patiesu, ņemot vērā pieejamos pierādījumus.
Kāpēc proteīni mijiedarbojas?
Proteīna un proteīna mijiedarbība (PSI) ir augstas specifikas fiziski kontakti, kas izveidoti starp divām vai vairākām proteīna molekulām bioķīmisku notikumu rezultātā, ko vada mijiedarbība, kas ietver elektrostatiskos spēkus, ūdeņradi. saistīšana un hidrofobs efekts.
Kas ir funkcionālā saistība?
definīcija. Bināras attiecības starp bioloģiskām entītijām kad viena no tām modulē otru funkciju, izteiksmes, degradācijas vai stabilitātes un attiecības ziņāstarp partneriem nevar noteikt kā tiešus, tāpēc starpposmi ir netieši klāt.
