Prolīns bieži atrodas α spirāles galā vai pagriezienos vai cilpās. Atšķirībā no citām aminoskābēm, kas polipeptīdos pastāv gandrīz tikai transformācijas formā, prolīns peptīdos var pastāvēt cis-konfigurācijā.
Vai alfa spirāles satur prolīna atliekas?
Tagad, kad proteīnu datu bankā ir vairāk nekā 30 000 proteīnu struktūru, ir skaidrs, ka prolīna atliekas atrodas α-helikās, kur tām bieži ir svarīga loma proteīna struktūrā un funkcijās.
Kādas aminoskābes ir alfa spirālēs?
Jebkura no 20 aminoskābēm var piedalīties α-spirālē, taču dažas ir vairāk atbalstītas nekā citas. Ala, Glu, Leu un Met visbiežāk atrodami spirālēs, savukārt Gly, Tyr, Ser un Pro ir mazāk ticams.
Vai beta lapas satur prolīnu?
Proline netiek atbalstīts beta lokšņu struktūrās, jo tas nevar pabeigt H-saišu tīklu. Ja prolīns parādās loksnēs, tas var būt izliekumā vai loksnes malā, kur aminoūdeņraža saites veidotāja trūkums nav kritisks.
Kas satur alfa spirāles?
Alfa spirāle (α-spirāle) ir izplatīts motīvs olb altumvielu sekundārajā struktūrā un ir labās rokas spirāles konformācija, kurā katrs mugurkauls N-H grupē ūdeņradi. saites ar mugurkaulu C=O. aminoskābju grupa, kas proteīna secībā atrodas četrus atlikumus agrāk.
