Arabinoze ir piecu oglekļa cukurs, kas ir plaši sastopams dabā un var kalpot kā vienīgais oglekļa avots daudzās baktērijās. Olb altumvielu produkti no trim gēniem (araB, araA un araD) ir nepieciešami arabinozes degradācijai Enterobacteriaceae ģimenes locekļiem, piemēram, E. coli un S.
Ko arabinoze nodara baktērijām?
Tādējādi, kad ir arabinoze, lai ieslēgtu arabinozes operonu, GFP tiek ražots un baktērijas var fluorescēt. Bez arabinozes GFP gēns netiek ekspresēts un nav fluorescences. Tādējādi, mainot barības vielu sastāvu, pētnieks var kontrolēt, kad (un vai) transformētajās baktērijās notiek florescence.
Kāda ir arabinozes loma baktēriju transformācijā?
Arabinoze darbojas kā AraC allosteriskais regulators, mainot DNS vietām, ar kurām tā saistās un kā tā veido dimēru. Atcerieties, ka arabinoze ir cukurs, ko katabolizē AraBAD operona proteīni. Kad arabinozi pievieno videi, kurā dzīvo E. coli, tā cieši saistās ar AraC.
Kāpēc tiek izmantota arabinoze?
Izmantošana bioloģijā
Sintētiskajā bioloģijā arabinozi bieži izmanto kā vienvirziena vai atgriezenisku proteīnu ekspresijas slēdzi saskaņā ar Pbadpromotors E. coli. Šo ieslēgšanas slēdzi var noliegt glikozes klātbūtne vai mainīt, pievienojot glikozi barotnē, kas ir katabolīta represijas veids.
Kāvai arabinoze ietekmē gēnu regulēšanu un ekspresiju baktērijās?
Kad ir arabinoze, araC atslābina DNS konfigurāciju, lai varētu notikt transkripcija, bet, ja šī ogļhidrāta nav, tas pats proteīns ierobežo DNS, lai samazinātu tās spēju saistīties. ar RNS polimerāzi.
