BLAST var izmantot vairākiem mērķiem. Tie ietver sugu identificēšanu, domēnu atrašanu, filoģenēzes noteikšanu, DNS kartēšanu un salīdzināšanu. Izmantojot BLAST, jūs, iespējams, varat pareizi identificēt sugu vai atrast homologas sugas.
Kam tiek izmantoti BLAST?
BLAST ir datora algoritms, kas ir pieejams lietošanai tiešsaistē Nacionālā biotehnoloģijas informācijas centra (NCBI) vietnē, kā arī daudzās citās vietnēs. BLAST var ātri saskaņot un salīdzināt vaicājuma DNS secību ar secību datu bāzi, kas padara to par būtisku rīku notiekošajos genoma pētījumos.
Kas ir BLAST tehnika?
BLAST tehnika ir sūdzību risināšanas metode, ko izstrādājis Alberts Barneto . Mnemonika nozīmē ticēt, klausīties, atvainoties, apmierināt un pateikties (1. tabula). 6. Šajā rakstā ir aprakstīta tā lietderība pacientu aprūpē un kā klīnisks mācību līdzeklis.
Kā BLAST darbojas DNS?
Kā darbojas BLAST? BLAST identificē homologas sekvences, izmantojot heiristisko metodi, kas sākotnēji atrod īsas atbilstības starp divām sekvencēm; tādējādi metode neņem vērā visu secības telpu. Pēc sākotnējās atbilstības BLAST mēģina sākt vietējo līdzinājumu no šīm sākotnējām atbilstībām.
Kāpēc BLAST ir ātrāks par Fasta?
Algoritma izpildlaika sarežģītības ziņā BLAST ir ātrāks par FASTA, meklējot tikai nozīmīgākos modeļussecības. BLAST un FASTA jutība (vai precizitāte) mēdz būt atšķirīga nukleīnskābju un olb altumvielu sekvencēm (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
