Agarozes gēlus izmanto kopā ar DNS, jo biomolekulas ir lielākas (DNS fragmenti bieži vien ir tūkstošiem kDa). Olb altumvielu gēliem poliakrilamīds nodrošina labu izšķirtspēju, jo daudz mazāks izmērs (tipiski 50 kDa) ir piemērotāks gēla blīvākām starpmolekulārajām spraugām.
Kāda ir atšķirība starp agarozes gēla elektroforēzi un poliakrilamīda gēla elektroforēzi?
Galvenā atšķirība starp agarozi un poliakrilamīdu ir tāda, ka agarozi izmanto agarozes gēla elektroforēzē (AGE) galvenokārt DNS atdalīšanai, savukārt poliakrilamīdu izmanto poliakrilamīda gēlā. elektroforēze (PAGE) galvenokārt proteīnu atdalīšanai.
Kāpēc poliakrilamīda gēli ir labāki par agarozes želeju?
Poliakrilamīda gēliem ir šādas trīs galvenās priekšrocības salīdzinājumā ar agarozes gēliem: (1) to izšķirtspēja ir tik liela, ka tie var atdalīt DNS molekulas, kuru garums atšķiras tikai par 0,1% (t.i., 1 bp no 1000 bp).). (2) Tie var uzņemt daudz lielāku DNS daudzumu nekā agarozes gēli.
Kāpēc, raksturojot proteīnus, agarozes vietā izmanto poliakrilamīdu?
Poliakrilamīds un agaroze ir divas atbalsta matricas, ko parasti izmanto elektroforēzē. … Agarozei ir liels poru izmērs, un tā ir piemērota nukleīnskābju un lielu olb altumvielu kompleksu atdalīšanai. Poliakrilamīdam ir mazāks poru izmērs un tas ir ideāli piemērotsatdala lielāko daļu olb altumvielu un mazāku nukleīnskābju.
Kāpēc tiek izmantots poliakrilamīda gēls?
Poliakrilamīda gēla elektroforēzi (PAGE) parasti izmanto proteīnu analīzei, un to var izmantot arī, lai atdalītu nukleīnskābju fragmentus, kas mazāki par 100 bp. Nukleīnskābes parasti analizē, izmantojot nepārtrauktu bufera sistēmu, kurā visā gēlā ir nemainīgs bufera sastāvs, pH un poru izmērs.
