Turpretim lielākā daļa eikariotu DNS ligāžu kopā ar arheālajiem un bakteriofāgu enzīmiem ietilpst otrajā apakšgrupā; šie fermenti izmanto ATP kā kofaktoru.
Vai ligasēm ir nepieciešams ATP?
Parasti tiek izmantotas divas DNS ligāzes. … T4 ligāzei ir nepieciešams ATP , savukārt E. coli ligāzei nepieciešams NAD+ (nikotīnamīda adenīna dinukleotīds ir koenzīms, kas sastāv no 2 nt, kas savienotas caur to fosfātu grupām). Abi katalizē 5'-fosfāta un 3'-OH grupas savienošanos, veidojot fosfodiestera saiti.
Kāpēc ligasēm vajadzīgs ATP?
DNS ligācijas reakcijas divi posmi
DNS ligācijas reakcijai ir divi pamata posmi. Pirmkārt, DNS galiem ir nejauši jāsaduras un jāpaliek kopā pietiekami ilgi, lai ligase tiem pievienotos. …Lai ferments varētu veikt turpmākas reakcijas, AMP fermenta aktīvajā vietā ir jāpapildina ar ATP.
Kādas ir ligāžu funkcijas?
DNS ligāzēm ir būtiska loma genomiska integritātes saglabāšanā, savienojot DNS fosfodiestera mugurkaula lūzumus, kas rodas replikācijas un rekombinācijas laikā, kā arī DNS bojājuma un tā rezultātā. remonts. Trīs cilvēka gēni LIG1, LIG3 un LIG4 kodē no ATP atkarīgās DNS ligāzes.
Kas ir ligazes, tās darbojas aktīvi vai pasīvi?
DNS ligāze ir aktīva DNS replikācijas, labošanas un rekombinācijas procesa laikā. To plaši izmanto vienvirziena remontādzīvo organismu dupleksās DNS pārrāvumi, izmantojot dubultās spirāles komplementāro virkni kā veidni, savukārt dažas formas var īpaši labot dubultās virknes bojājumus.
